এককত্ব বিশ্ববিদ্যালয় নোটস - ডিজিটাল জীববিজ্ঞান (25 এর 7)

রেমন্ড ম্যাককলে: ডিজিটাল জীববিজ্ঞান

বক্তা:

রাইমন্ড অনুসন্ধান করেছেন যে কীভাবে প্রযুক্তির জীবনকে প্রয়োগ করা হচ্ছে - জীববিজ্ঞান, জিনেটিক্স, চিকিত্সা, কৃষিকাজ - আমাদের প্রত্যেককে প্রভাবিত করছে .. গল্পগুলি বলা এবং নীচে থেকে পৃথিবীর উদাহরণগুলি ব্যবহার করার জন্য এই মুহূর্তে দেখা যাচ্ছে যে এই পরিবর্তনগুলি এখনই কীভাবে ঘটছে তা দেখানোর জন্য।

রেমন্ড হলেন: সিঙ্গুলারিটি ইউনিভার্সিটির বায়োটেক ট্র্যাকের চেয়ার (http://singularityu.org/), একটি সিলিকন ভ্যালি থিঙ্ক ট্যাঙ্ক নেতৃবৃন্দকে তাত্পর্যপূর্ণ প্রযুক্তি সম্পর্কে প্রশিক্ষণের জন্য নিবেদিত। সহ-প্রতিষ্ঠাতা এবং বায়োক্রিয়াসের চিফ আর্কিটেক্ট (http://biocurious.org/), বায়োটেকের হ্যাকারস্পেস, লাভ-অযোগ্য নয় যেখানে পেশাদার বিজ্ঞানী, ডিআইওয়াইবিও শখবিদ এবং উদ্যোক্তারা একসাথে পরবর্তী বড় জিনিসটি ডিজাইন করার জন্য বেরিয়ে আসেন একটি সিলিকন ভ্যালি গ্যারেজ দলের একটি অংশ যা পরবর্তী প্রজন্মের ডিএনএ সিকোয়েন্সিং বিকাশ করেছে ইলুমিনাতে, যেখানে তিনি বায়োইনফর্ম্যাটিক্স, ক্যান্সার সিকোয়েন্সিং এবং ব্যক্তিগত জিনোমিক্সে কাজ করেছিলেন। তার কাজ এবং গল্পটি তারযুক্ত, ফোর্বস, সময় এবং প্রকৃতিতে প্রদর্শিত হয়েছে।

যা আমি রেমন্ডের কাছ থেকে শিখেছি

ব্র্যাডের মতো, রেমন্ডও একটি ব্যবহৃত প্রিজি, তার স্লাইডগুলির লিঙ্কগুলি এখানে

বায়োটেকনোলজিকে তিনি যে বিবেচনা করেন তার ক্ষেত্রটি নির্ধারণ করে রেমন্ড শুরু করেছিলেন: বিশ্ব অর্থনীতির ১/৩: এটির ওষুধ, কৃষি, শক্তি, উত্পাদন ও সরবরাহ শৃঙ্খলা (অনেক সংজ্ঞা আলাদা আলাদা প্রযুক্তিগত থিমগুলিতে রূপান্তরিত হচ্ছে এবং এটি এখন অবধি বোঝা উচিত)

রেমন্ড অনুসারে ডিজিটাল বায়োলজির তিনটি অংশ রয়েছে: ডিএনএ সিকোয়েন্সিং, জেনেটিক ইঞ্জিনিয়ারিং এবং সরঞ্জামগুলিতে ডেমোক্র্যাটাইজিং অ্যাক্সেস।

তাহলে সিকোয়েন্সিং কি?

জিনোম সিকোয়েন্সিং একটি জিনোমে ডিএনএ নিউক্লিওটাইডস বা ঘাঁটিগুলির ক্রম নির্ধারণ করে - একটি জীবের ডিএনএ তৈরি করে আস, সিএস, জিএস এবং সের ক্রম। মানব জিনোম এই জিনগত অক্ষরের প্রায় 3 বিলিয়ন এর উপরে গঠিত।

আজ, বৃহত আকারে ডিএনএ সিকোয়েন্সিং - পুরো জিনোম সিকোয়েন্সিংয়ের মতো উচ্চাভিলাষী প্রকল্পগুলির জন্য প্রয়োজনীয় স্কেল - বেশিরভাগ উচ্চ-প্রযুক্তি মেশিন দ্বারা সম্পন্ন হয়। আপনার চোখ কোনও বাক্য পড়ার জন্য চিঠিগুলির একটি ক্রম স্ক্যান করার সাথে সাথে এই মেশিনগুলি ডিএনএ ঘাঁটির একটি অনুক্রম "পড়া" করে।

একটি ডিএনএ সিকোয়েন্স যা জীবনের রাসায়নিক বর্ণমালা থেকে আমাদের লিখিত বর্ণগুলির বর্ণমালায় অনুবাদ করা হতে পারে:

এটিই, ডিএনএর এই নির্দিষ্ট অংশে, একটি অ্যাডিনিন (এ) এর পরে একটি গুয়ানিন (জি) হয়, তার পরে থাইমাইন (টি) হয়, যার পরে একটি সাইটোসিন followed, অন্য একটি সাইটোসিন by আসে এবং তাই চালু.

জেনেটিক ইঞ্জিনিয়ারিং কী? এটি একটি জীবের মধ্যে নতুন ডিএনএ যুক্ত করার প্রক্রিয়া।

আমি উভয় পদকে যেভাবে বুঝতে পেরেছি: সিকোয়েন্সিং ছবি আঁকছে, জেনেটিক ইঞ্জিনিয়ারিং ছবিটি পরিবর্তন করছে।

উইকিপিডিয়া বলেছেন:

“জেনেটিক ইঞ্জিনিয়ারিং, যাকে জেনেটিক মডিফিকেশনও বলা হয়, এটি হ'ল বায়োটেকনোলজি ব্যবহার করে কোনও জীবের জিনোমের সরাসরি কারসাজি। এটি কোষের জেনেটিক মেকআপ পরিবর্তনের জন্য ব্যবহৃত প্রযুক্তির একটি সেট যা উন্নত বা অভিনব জীব উত্পাদন করতে প্রজাতির সীমানা ও তার ওপরে জিনের স্থানান্তর সহ। প্রথমে ডিএনএ অনুক্রম তৈরি করার জন্য আণবিক ক্লোনিং পদ্ধতি ব্যবহার করে, বা ডিএনএ সংশ্লেষ করে, এবং তারপরে হোস্ট অর্গানিজমে inুকিয়ে দিয়ে হোস্ট জিনোমে প্রথমে আগ্রহের জিনগত উপাদানগুলি বিচ্ছিন্ন করে এবং অনুলিপি করে হোস্ট জিনোমে নতুন ডিএনএ প্রবেশ করা যেতে পারে ”"

সরঞ্জাম এবং শর্তাদি

বায়োটেক আমার পৃথিবীতে অনেকগুলি "ব্ল্যাক বক্স" এর সাথে সমান হয়েছে। এটি এমন অস্বাভাবিক অজানা যা আমি কেবল "জানতে" পারি না। আমি খুঁজে পেয়েছি খোলা কালো বাক্সগুলি ভাঙা আমার মুখোমুখি হওয়া সম্ভবত সবচেয়ে ভাল ব্যবহার। বায়োটেক কথোপকথনে প্রথম সরঞ্জামটি হ'ল ডিএনএ মাইক্রো অ্যারে। এটি মূলত একটি বায়োচিপ। এই শব্দটি ওয়েবে বিস্তৃতভাবে ব্যাখ্যা করা হয়েছে, মাইক্রোআরিয়ে ব্যাখ্যা করে আরও একটি ভাল চিত্র নীচে আটকানো হয়েছে।

চালু হওয়া সর্বাধিক ব্যবহারকারীর বন্ধুত্বপূর্ণ এবং গ্রাহক মুখোমুখি সরঞ্জামটি ছিল 23 ম্যান্ড। এই সংস্থাটি আপনাকে এবং আপনার পরিবার সম্পর্কে $ 99 এর জন্য আপনার ডিএনএ যা বলে তা নির্ধারণ করতে আপনাকে সহায়তা করে। এটির জন্য কেবল কিছুটা থুতু ও ভায়োলা দরকার। মজার বিষয় হল, 23 এবং আমার কয়েকটি এফডিএ সমস্যা নিয়েছে। 23 এবং আমার দাবি করেছে যে তারা কেবল বিনোদনমূলক জিনোমিক্স করছে। এফডিএ বলেছিল, "আমরা জানি না যে ক্যান্সারে আক্রান্ত লোকেরা যা বলছেন তা কীভাবে বিনোদনমূলক হয়"। ডিএনএ রিপোর্ট দেখতে কেমন লাগে তার উদাহরণগুলি প্রিজি লিঙ্কে প্রদর্শিত হয় এবং অত্যন্ত প্রস্তাবিত হয়।

জীববিজ্ঞানের ডিজিটাইজেশনের ফলস্বরূপ, বায়োটেক শিল্প মুরের আইনকে অনুসরণ করছে এবং বাস্তবে এটি অনেক দ্রুত চলছে। একটি মানব জিনোমকে ডিকোড করার খরচ ২০০০ সালে ১০০ মিলিয়ন ডলার থেকে নেমে এখন $৯ ডলারের নিচে নেমেছে। রেমন্ড বলেছেন যে এটি 2019 সালে একটি টয়লেট ফ্লাশ করার সমান হবে।

কেন এই সমস্ত প্রাসঙ্গিক?

রেমন্ড একটি ব্যক্তিগত উদাহরণ ভাগ করেছেন যা ভীতিজনক তবে আকর্ষণীয় ছিল। যখন রেমন্ড তার নিজস্ব সিকোয়েন্সিংটি সম্পন্ন করে জানতে পেরেছিল যে তিনি এএমডি (বয়সের সাথে সম্পর্কিত ম্যাকুলার অবক্ষয়) পাওয়ার উচ্চ সম্ভাবনা রয়েছে। এটি স্পষ্টতই ভীতিজনক ছিল, তবে রেমন্ড এটি সম্পর্কে কিছু করেছিল। এটি "অজ্ঞতা সুখী" এর বিরুদ্ধে পুরো মামলা।

যেহেতু রায়মন্ড একটি করণীয় তিনি নীচের সমস্ত কিছু করেছেন এবং বাস্তবে এটিএমডি কে কাটিয়ে উঠতে গবেষণাকে সহায়ক করেছেন অর্থপূর্ণ উপায়ে

স্বাস্থ্যসেবাতে প্রান্তটিকে কাটা হিসাবে বিবেচনা করা হয় তার কয়েকটি উদাহরণ:

  • ভেরিনাটা স্বাস্থ্য: এই সংস্থাটি এখন আলোকসত্তা দ্বারা অধিগ্রহণ করা হয়েছে, এটি ভ্রূণের জন্য আক্রমণাত্মক পিতামাতার পরীক্ষা সরবরাহ করে। পুরো ধারণাটি হ'ল স্বাস্থ্যসেবা প্রতিক্রিয়াশীল না করে আরও ভবিষ্যদ্বাণীপূর্ণ করা
  • ম্যামোগ্রাম এবং কোলোনস্কোপিগুলির সমাপ্তি, সাধারণভাবে আক্রমণাত্মক কৌশলগুলি নিকটে। আমার মনে আছে যখন আমার বাবার একটি অ্যানজিওগ্রাফি করা হয়েছিল, প্রক্রিয়াটি বেশ আক্রমণাত্মক ছিল, গত বছর যখন আমার মা একই পদ্ধতিটি করেছিলেন তখন নলটির সন্নিবেশটি তার বাহুর অভ্যন্তরের অভ্যন্তরের পক্ষে ছিল না
  • চিকিত্সা দ্রুত ডিজিটালাইজড হচ্ছে এবং চিকিত্সার অনেক দীর্ঘ চিকিত্সা প্রয়োজন ডাক্তারের কাছে সাশ্রয়ী মূল্যের হয়ে উঠছে (আমার দৃষ্টিতে বড় হাসপাতালগুলি বা ডায়াগনস্টিক ল্যাবগুলির পক্ষে ভাল ভাড়া দেওয়া যায় না)। নীচে দেখানো এই মেশিনটি 20 মিনিটের মধ্যে বেশিরভাগ গলা সংক্রমণের জন্য পরীক্ষা করতে পারে এবং মেশিনটির মূল্য 200 ডলার

বায়োটেক বা ডিজিটাল বায়োলজিতে সমস্ত প্রযুক্তিগত অগ্রগতির মূলত (বিশেষত ব্যয় হ্রাস) একটি কাজের প্রবাহকে ডিজিটাইজ করার কাজ। শূন্যগুলি এবং সেগুলি বেশ আশ্চর্যজনক, প্রকৃতপক্ষে আমাদের মস্তিষ্ক জিরো এবং সেগুলি দ্বারাও তারযুক্ত (নিউরোসায়েন্স বিভাগে আরও এটি), নিম্নলিখিত তিনটি প্রযুক্তি / সংস্থাগুলি সিকোয়েন্সিং এবং জেনেটিক ইঞ্জিনিয়ারিংয়ের প্রক্রিয়া গ্রহণ করেছে এবং এর প্রক্রিয়াটিকে ম্যাপ করেছে একটি ডিজিটাল কাঠামো:

  • অয়ন টরেন্ট আধা কন্ডাক্টর সিকোয়েন্সিং এই হাইপার লিঙ্কটি আমি দেখলাম এমন দুর্দান্ততম ভিডিওগুলির মধ্যে একটি (এবং আমি কীভাবে মিডিয়ামে ভিডিওগুলি প্রবর্তন করতে পারি তা শিখেছি!) এটি এই জাতীয় অন্তর্দৃষ্টি যা মুর আইনকে সক্ষম করে। আমরা প্রায়শই মুরের আইনটিকে মর্যাদার জন্য গ্রহণ করি, তবে প্রায়শই এটি ভুলে যায় যে এই মানবিক অনুভূতিতে এই "আহা" মুহুর্ত রয়েছে যা বলে যে "কেন আমরা ডিজিটাল ক্যামেরাগুলিতে মৌলিক কিছু ব্যবহার করতে পারি না এবং ডিএনএ সিক্যুয়েন্স করার জন্য একই ধারণাটি প্রয়োগ করতে পারি না (অনুক্রমটি নির্ণয় করে) জি, এ, টি এবং সি) এর… ”কেবলমাত্র ভিডিওটি দেখুন।
  • জেনিয়াচিপ এখন রোচে অর্জিত, জেনেটিক তথ্য সর্বজনীনভাবে উপলব্ধ করার একটি মিশন রয়েছে
  • অক্সফোর্ড ন্যানোপুর টেকনোলজিসগুলি জৈবিক বিশ্লেষণকে বহনযোগ্য করতে ইউএসবি স্টিকটি খুব কার্যকরভাবে ব্যবহার করছে। তাদের কাজের প্রবাহ পরীক্ষা করে দেখুন

যদিও উপরে বর্ণিত সরঞ্জামগুলি বেশিরভাগই সিকোয়েন্সিংয়ের সাথে সম্পর্কিত, জিনেটিক ইঞ্জিনিয়ারিংয়ের প্রক্রিয়াটি সফ্টওয়্যার বিকাশের মতোই, জিনগুলি অনুলিপিটি পেস্ট করে এবং মূলত নতুন ধরণের জীব উদ্ভূত হয়। প্লাজমিড সম্পাদকটি দেখতে এটি দেখতে (আমারাই মনে হয় তারা অনেক সুন্দর / আবেদনময়ী দেখতে পারেন)

চারটি জেনেটিক ইঞ্জিনিয়ারিং সরঞ্জাম এর সাথে চারপাশে খেলার উপযুক্ত:

  • ডিএনএ ২.০ প্রোটিন এবং ভেক্টর ইঞ্জিনিয়ারিংয়ের প্ল্যাটফর্ম, এক্সপ্রেশন ভেক্টর, ফ্লুরোসেন্ট এবং ক্রোমোজেনিক প্রোটিন, সেল স্ট্রেন এবং রিএজেন্টস, পাশাপাশি জিনের নকশা, অপ্টিমাইজেশন, সংশ্লেষণ এবং ক্লোনিংয়ের মতো পণ্যগুলির জন্য গবেষণা সম্প্রদায়ের সমাধানগুলির একটি সংহত পাইপলাইন সরবরাহ করে। তাদের ভিডিও দেখুন (পাকিস্তানে ইউটিউব খুলছে !!!)

জেনেটিক ইঞ্জিনিয়ারিং সম্পর্কে অনেক উদ্বেগ হাইলাইট হওয়ার পরে (ম্যানসেন্টো প্রায়শই জীববৈচিত্র্যকে ঘৃণা করে এমন মন্দ সংস্থা হিসাবে উদ্ধৃত করা হয়), কিছু নির্দিষ্ট জিন ছিটকে দেওয়ার জন্য একটি মামলা করা যেতে পারে (যদিও আমি স্বীকার করি আমি আমাদের বাস্তুতন্ত্রের উপর প্রভাবটি পুরোপুরি বুঝতে পারি না) যদি এটি ঘটে)

ইতিমধ্যে প্রথম মানব ভ্রূণটি সিআরআইএসপিআর দ্বারা "সম্পাদিত" হয়েছে তবে এই সংবাদ প্রকাশ বা ভাগ করে নিতে খুব বিতর্কিত হয়েছিল।

রেমন্ডের কাজটি সম্পর্কে আমি সর্বশেষে যে জিনিসটি ভাগ করতে চাই তা হ'ল তার সুপার কুল লার্নিং / বায়ো-কুরিয়াস নামের শেয়ার্ড স্পেস কোম্পানি! আমি এই গ্রীষ্মে ক্যালিফোর্নিয়ায় এই সুবিধাটিতে কিছুটা সময় ব্যয় করার পরিকল্পনা নিয়েছি

দুর্দান্ত ধারণাটি হ'ল জীববিজ্ঞানের ভয়ঙ্কর শর্তাদি এবং সরঞ্জামগুলিকে আরও অ্যাক্সেসযোগ্য করে তোলা। এই চিন্তাটি গভীরভাবে আমার সাথে অনুরণিত হয়, কারণ আমিও বিশ্বাস করি যে মূলধন বরাদ্দ কিছু লোকের সুবিধাদি হওয়া উচিত নয় এবং প্রকৃতপক্ষে জনগণকে উত্সাহিত করে উন্নত মানের বিনিয়োগের সিদ্ধান্ত নেওয়া যেতে পারে। এজন্য কর্পোরেশন এবং তাদের নেতাদের তাদের মানসিকতা এবং নিরাপত্তাহীনতা কাটিয়ে উঠতে হবে। যদিও আমি মনে করি এর চেয়েও বড় সমস্যা হ'ল বেশিরভাগ ব্যবসায়ী নেতারা তাদের সংস্থাগুলি কীভাবে এবং কেন মূল্যবান তা বেশিরভাগই বুঝতে পারেন না, তবে এটি অন্য সময়ের জন্য আলোচনা।

তাহলে বায়ো-কৌতূহল আজ পর্যন্ত কী সরবরাহ করেছে? মাইক্রোকুলাস একটি দুর্দান্ত উদাহরণ।

আমি যা লিখেছি তার বেশিরভাগ সংক্ষিপ্ত করে রেমন্ডের সর্বশেষ আলোচনা।

এই লিঙ্কটিতে বিশদ নোটের সম্পূর্ণ সেট উপলব্ধ